Синонимы |
бета-NAD + -зависимая ДНК-лигаза, бета-NAD + -зависимая ДНК-лигаза, дезоксирибонуклеат-лигаза, дезоксирибонуклеиновая кислота-триназа, дезоксирибонуклеиновая кислота-лигаза, дезоксирибонуклеиновая джиназа, дезоксирибонуклеиновая лигаза, ДНК-дезоксирибоназойная ДНК-фермент, ДНК-лигезомная ДНК-фермент (NAD), фермент репарации ДНК, фермент, соединяющий ДНК, LigA, лигаза, полинуклеотид (никотинамид-адениндинуклеотид), ДНК-лигаза LigN, MimiLIG, MsEPV, MtuLigA, NAD (+) -зависимая ДНК-лигаза, NAD + -зависимая ДНК-лигаза, NAD + лигазы, НАД + -зависимой ДНК-лигазы, НАД + -зависимой ДНК-лигазы А, НАД-зависимой ДНК-лигазы, NDL, полидезоксирибонуклеотид синтазы (НАД +), полидезоксирибонуклеотид синтазы [НАД +], полинуклеотид лигазы, полинуклеотид синтетазы, полинуклеотид синтетазы (никотинамид-аденин-динуклеотид), Rv3014c , Синтетаза, полидезоксирибонуклеотид (никотинамид-адениндинуклеотид), ДНК-лигаза T4, ДНК-лигаза Taq, ДНК-лигаза Tfi, ДНК-лигаза Tth, wBm-LigA |
Комментарии |
Фермент, обычно встречающийся в бактериях, катализирует лигирование цепей ДНК с 3'-гидроксильными и 5'-фосфатными концами, образуя фосфодиэфир и запечатывая определенные типы однонитевых разрывов в дуплексной ДНК. Катализ происходит по трехступенчатому механизму, начиная с активации фермента NAD +, образуя фосфорамидную связь между аденилатом и остатком лизина. Затем аденилатная группа переносится на 5'-фосфатный конец субстрата, образуя блокированную структуру 5 '- (5'-дифосфоаденозин) - [ДНК]. Наконец, фермент катализирует нуклеофильную атаку 3'-ОН-конца на закрытом конце, что приводит к образованию фосфодиэфирной связи и высвобождению аденилата. РНК в некоторой степени также может действовать как субстрат. ЕС? 6.5.1.1, ДНК-лигаза (АТФ), ЕС? 6.5.1.6, ДНК-лигаза (АТФ или НАД +) и ЕС? 6.5.1.7, ДНК-лигаза (АТФ, АДФ или GTP). |